La APAMEFA tiene como principales objetivos los siguientes:

1. Desarrollar y Fortalecer la Medicina de Familia como Disciplina Acadêmica en el continente Americano.
2. Fomentar el espacio académico para el Intercambio de Medicos de Familia, Residentes, Estudiantes y Profesionales de la Salud que demuestren interes y aptitud por la disciplina.
3. Identificar y apoyar liderazgos que puedan colaborar para el progreso sólido de la Medicina de Família como disciplina académica en sus respectivos paises.
4. Promover la difusión del conocimiento en Medicina de Familia.
5. Interactuar con organizaciones internacionales análogas con vista a la promoción de la salud global.