A APAMEFA tem como principais objetivos os seguintes:

1. Desenvolver e Fortalecer a Medicina de Família como Disciplina Acadêmica no continente americano.
2. Fomentar um espaço acadêmico para o Intercâmbio de Médicos de Familia, Residentes, Estudantes e Profissionais da Saúde que demonstrem interesse e aptidão pela disciplina.
3. Identificar e apoiar lideranças que possam colaborar para o progresso sólido da Medicina de Família como disciplina acadêmica nos seus respectivos países.
4. Promover a difusão do conhecimento em  Medicina de Família.
5. Interagir com organizações internacionais análogas com vista à promoção da saúde global.